小型蒸汽锅炉运行中严禁无水或缺水燃烧，以免造成事故，若发现小型燃气蒸汽锅炉内严重缺水，应立即停止加热，待小型燃气蒸汽锅炉冷却后，查明原因，排除故障。切不可冒然加水，防止击裂炉膛。小型燃气蒸汽锅炉操作人员必须熟练操作，掌握小型燃气蒸汽锅炉性能、操作规程及工艺流程，杜绝违章操作。冬季停炉时，必须放净炉水，防止冻坏小型燃气蒸汽锅炉。夏季不用小型燃气蒸汽锅炉时，应放净炉水，用石灰进行干式保养。
若发现小型燃气蒸汽锅炉膛抽力下降，炉内应清灰，在烟筒的颈部或炉门内用橡胶软管接自来水进行冲洗。小型燃气蒸汽锅炉内水垢清除可在使用满1年后打开人孔观察结垢厚度，加除垢剂除垢，也可加5-10kg烧碱或盐酸加水煮炉24-36h后，除垢洗炉。根据当地水质，每半年进行一次清洗作业，清除小型燃气蒸汽锅炉水垢，否则，对流管容易结垢，导致对流管堵塞而烧坏。
