生物质锅炉在运行的过程中其不同种类的燃料的含水量其区别是很大的，在进行使用时主要取决于燃料的种类和储存方式，生物质锅炉为了能保持生物质燃料的稳定性，在进行使用之前需要进行晾晒。
生物质锅炉的含水量增加，这样就会在一定程度上降低了炉膛蓄热温度，有效的增加燃料在燃烧室的不完全燃烧，其设备的含水量过大是国能生物质电厂带不上负荷的主要原因。
生物质锅炉在燃烧过程中，水分因蒸发、汽化要消耗大量的汽化热。水分含量大的燃料其燃烧后的烟气体积较大（水变为蒸汽比体积增加了1200倍），由于出口烟气有130℃左右温度，因此随烟气带走的热量损失较多（此现象可以通过烟囱的排烟，观测到呈现大量乳白气体），锅炉的热效率就较低。
生物质锅炉的研制技术和使用技术都比较的完善和成熟，生产制造流程清晰，工艺明确，值得大家的选择。生物质锅炉对空气污染没有影响，因为使用的是生物质能源(植物秸秆、树枝、杂草)，产生的只有二氧化碳，而且还有专门的去硫除尘装置，排气扇和烟囱设计的也很合理，通过这些装置，产生的气体中的有害物被降到很低，比其他锅炉都要好，排放指数远小于我国的安全排放要求。
生物质锅炉在资金消费上，燃煤的锅炉使用的是煤炭，现在我国对煤炭的开采变少加上能源结构的调整煤炭的价格也略有提高;燃气锅炉对天然气或者液化气的使用量是巨大的，尤其是工业用的锅炉根不能用这种锅炉。而生物质锅炉原料众多，十分便宜，适合大力使用。
